Полипептиды являются макромолекулами, и каждая полипептидная последовательность имеет свои физические и химические свойства *. Некоторые полипептиды трудно синтезировать, другие относительно просты в синтезе, но трудно очистить, они в основном нерастворимы в воде, поэтому при очистке эти гидрофобные пептиды должны растворяться в неводных растворителях или специальных буферах, но эти растворители или буферы могут быть непригодны для применения в биоэкспериментальных системах, и исследователи не могут использовать полипептиды для исследовательских целей.
　　
После многих лет исследований и накопления синтезаторы Boosen дают некоторые советы исследователям по полипептидному дизайну:
　　
Быть трудным
　　
Уменьшение длины последовательности Увеличение длины пептидов приводит к снижению чистоты необработанных продуктов и облегчает доступ к пептидам с менее чем 15 остатками. Когда количество пептидных цепочек увеличивается более чем до 20, необходимо учитывать количество нормального продукта. На практике остатки менее 20 процентов как правило дают более высокие результаты.
　　
2. Пептиды, которые имеют явное преимущество в уменьшении гидрофобных остатков, особенно в районах, расположенных от 7 до 12 остатков на конце C, вызывают трудности с синтезом и, как правило, считаются не * спаривающимися из - за образования бета - дисков в синтезе. Конечно, может быть полезно заменить несколько полярных остатков или добавить Gly или Pro легко открывающиеся пептидные структуры.
　　
3.Уменьшить "трудные" остатки имеют несколько Cys, Met, Arg, Try остатки, как правило, трудно синтезировать. Сер обычно можно заменить без окисления.
　　
Улучшение растворимости
　　
1. Изменение N - или C - концевых кислотных пептидов (с отрицательным зарядом при значении PH 7) Мы предлагаем; N - концевой ацетилированный C - конец сохраняет свободные карбоксильные радикалы для увеличения отрицательного заряда. Щелочные пептиды (PH 7 с положительным зарядом) C - концевые аминокислоты n - сегментного свободного аминокислоты для увеличения положительного заряда.
　　
Сокращенная или удлиненная последовательность Некоторые последовательности содержат большое количество гидрофобных аминокислот, таких как Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met,
　　
Tyr, Ala и т. Д. Когда эти гидрофобные остатки более 50%, как правило, трудно растворить. Чтобы увеличить полярность пептидов, может помочь удлиненная последовательность. Другим вариантом является уменьшение длины пептидной цепи путем уменьшения гидрофобных остатков для увеличения полярности. Чем выше полярность пептидной цепи, тем больше вероятность растворения в воде.
　　
Добавление растворимых остатков улучшает растворимость для некоторых полярных аминокислот. Кислотные пептиды могут быть добавлены на N - или C - концах.
　　
Щелочные пептиды могут быть добавлены Lys - Lys на N - или C - концах, если они не могут присоединиться к заряженной группе. Сер - Gly - Zer может быть добавлен к N или C. Однако, когда два конца пептидной цепи не могут быть изменены, этот метод не работает.
　　
Растворимость цепочек пептидов, изменяющих последовательность путем замены одного или нескольких остатков, может быть улучшена путем изменения некоторых остатков последовательности, и замена отдельных остатков, как правило, может значительно изменить их гидрофобию. Это более консервативное изменение, например, замена Ала на Гли.
　　
Выбор различных « рамок» для изменения последовательности Если в одной последовательности может быть получено много взаимосвязанных или перекрывающихся полипептидов определенной длины, цель изменения последовательности может быть достигнута путем изменения начальной точки каждого полипептида. Принцип заключается в том, чтобы создать новый и лучший баланс между гидрофильными и гидрофобными остатками одного и того же полипептида или поместить « трудные» остатки одного и того же полипептида (например, два Cys) в два разных полипептида, а не в одну молекулу.
　　
Beijing Boosen Biotechnology Co., Ltd. - Полипептидный синтез